無菌性前列腺炎的病因尚不確定，有可能是由不良的生活習慣引起，也可能是病原體感染、炎癥和異常的盆底神經(jīng)肌肉活動等共同作用導(dǎo)致。

第一，病原體感染。雖然患者常規(guī)細菌培養(yǎng)未能分離出病原體，但可能與厭氧菌細菌變異等有關(guān)，如沙眼衣原體、支原體、寄生蟲、真菌，骶叢結(jié)核分支桿菌等等，也可能是該病的重要致病因素。第二，生活習慣因素。不良的生活習慣、經(jīng)常吃辣椒等刺激性食物、酗酒、頻繁的性生活、長期久坐或者長時間開車、騎自行車等，導(dǎo)致前列腺反復(fù)充血，從而導(dǎo)致無菌性前列腺炎。第三，排尿功能失調(diào)。某些因素引起尿道括約肌頻繁過度收縮，導(dǎo)致膀胱出口梗阻與殘余尿形成，造成尿液反流入前列腺，這樣不僅將病原體帶入前列腺，還可持續(xù)刺激前列腺誘發(fā)無菌性的前列腺炎。第四，精神心理因素。消極的情緒可引起植物神經(jīng)紊亂，造成后尿道神經(jīng)肌肉功能失調(diào)，導(dǎo)致骨盆區(qū)域的疼痛以及排尿功能的失調(diào)。第五，盆腔相關(guān)致病因素。部分前列腺炎患者常伴有前列腺外周帶靜脈叢擴張、痔、精索靜脈曲張等或者存在久坐、不適當?shù)男陨疃鸬穆耘枨怀溲?，提示部分慢性前列腺炎患者的癥狀可能與盆腔靜脈的充血相關(guān)，這可能是造成久治不愈的原因之一。第六，免疫反應(yīng)異常。也有學(xué)者認為無菌性的前列腺炎是一種過敏性的炎癥反應(yīng)或自身免疫反應(yīng)性疾病。第七，氧化應(yīng)激學(xué)說。前列腺內(nèi)部氧自由基產(chǎn)生和清除動態(tài)平衡被打破，機體抗氧化應(yīng)激反應(yīng)的能力減低，氧化應(yīng)激產(chǎn)物增加，導(dǎo)致神經(jīng)末梢敏感性增加。