對于慢性乙肝，采取的治療措施不同，所用的療程是有差別的。通常治療乙肝的抗病毒藥物有兩大類：一類是核苷類似物，每天口服；另外一類是干擾素，需要皮下注射。

核苷類似物的治療，絕大多數(shù)要長期治療，因?yàn)樗挥袑?shí)現(xiàn)表面抗原的陰轉(zhuǎn)才能停藥。如果表面抗原沒有陰轉(zhuǎn)，停藥之后有些人會(huì)復(fù)發(fā)。

對于干擾素的治療，本身它是可以提高表面抗原陰轉(zhuǎn)的幾率，有一部分人經(jīng)過干擾素治療，或者是聯(lián)合核苷類似物的治療，可以實(shí)現(xiàn)臨床的治愈，也就是實(shí)現(xiàn)表面抗原的陰轉(zhuǎn)。對于干擾素治療，如果實(shí)現(xiàn)了表面抗原的陰轉(zhuǎn)，通常在陰轉(zhuǎn)之后還要鞏固三個(gè)月到六個(gè)月的時(shí)間。每個(gè)人的療程差別非常大，有些是應(yīng)用一年的時(shí)間，有些是應(yīng)用兩年的時(shí)間，有些可能還要間斷反復(fù)的應(yīng)用干擾素。所以它的療程是不固定的，但一般不會(huì)長期應(yīng)用。